昨季に続いて感染が拡大した新型コロナウイルスの対応を巡り、福島Ｕは感染対策や検査結果の管理で反省が残った。
４月に６選手が陽性となり、クラスター（感染者集団）が発生した。トップチームの活動を約２週間休止し、同月２５日の岩手戦は延期された。
再開後は５月２日の敵地・長野戦から４連勝するなど奮闘したが、体調回復に苦しむ選手もいた。クラブは行動規範を厳格化。接触機会を減らすため、選手が飲料ボトル用の個人バッグを持つなど感染防止に努めた。
五輪開催に伴う中断期間中の８月、再びクラブが揺れた。５月の八戸戦でＪリーグ公式ＰＣＲ検査を受けていない選手を出場させたとして、結果を２－０から０－３に変更し、けん責とする処分がリーグから科された。
クラブは試合運営の権限を持つマッチコミッショナーが出場を認可したと主張。日本サッカー協会（ＪＦＡ）に不服申し立てをした。１０月にＪＦＡ不服申立委員会が敗戦扱いを取り消し、軽減した懲罰として罰金１５０万円を科した。
同委員会は「マッチコミッショナーによる積極的な提言と承認」を「大きな原因」と認定したが、福島Ｕを運営するＡＣ福島ユナイテッドの鈴木勇人社長は「罰金はクラブに責任がある証明」と落ち度を認め、確認体制の強化を打ち出した。
勝ち点剝奪の処分はＪリーグ史上初で、各クラブから注目を浴びた。来季もコロナ禍が続く可能性がある。勝ち点１は昇格、降格を左右し、選手の人生や街の活性化にも影響する。プレーに集中できる環境を確保し、応援の輪を広げるためにも、再発は許されない。